Hệ thống PGS có cấu trúc đơn giản gồm các đơn vị liên kết chặt chẽ, mỗi đơn vị đảm nhiệm một vai trò riêng trong sản xuất, giám sát và chứng nhận.
1. Hộ nông dân cá thể
- Học nguyên tắc hữu cơ và tiêu chuẩn PGS.
- Tham gia hoạt động nhóm, lập kế hoạch quản lý đồng ruộng và ký cam kết.
- Cung cấp sản phẩm bảo đảm chất lượng và khuyến khích nông dân khác tham gia.
2. Nhóm sản xuất
- Gồm ít nhất năm hộ ở gần nhau, hỗ trợ thành viên và thu thập cam kết.
- Lập kế hoạch sản xuất, tuyên truyền và tổ chức kiểm tra chéo định kỳ.
- Thúc đẩy mục tiêu chung và bảo đảm sự công bằng trong nhóm.
3. Liên nhóm
- Kết nối các nhóm sản xuất với người tiêu dùng, thương lái, cán bộ kỹ thuật và tổ chức hỗ trợ.
- Điều phối hồ sơ, kiểm tra chéo, lưu dữ liệu và xem xét tài liệu.
- Ra quyết định chứng nhận, xử lý gian lận, phối hợp sản xuất và quảng bá.
- Tránh xung đột lợi ích và báo cáo hoạt động hằng năm.
4. Nhóm điều phối PGS
- Bảo vệ quyền lợi các bên và duy trì, cập nhật tiêu chuẩn hữu cơ.
- Tiếp nhận nhóm mới, hỗ trợ cải tiến và điều phối lấy mẫu ngẫu nhiên.
- Tiếp nhận báo cáo, cấp giấy chứng nhận, quản lý nhãn hiệu và truyền thông PGS.